圣托马斯大学的历史可以追溯到1910年成立的圣托马斯学院，当时学院里主要设有高中和大专。直到1960年，圣托马斯学院才改名为圣托马斯大学，从那时起，学校就不再开设高中课程了。1963年，圣托马斯大学与纽布伦斯威克大学签订了一项协议，根据这项协议，圣托马斯大学可以在文科和教育学科方面继续其自己的学位课程的教学，同时，这项协议还指出，两所大学可以共同使用彼此的各项服务与设施，如共享图书馆等。圣托马斯大学的学生也因此得益于纽布伦斯威克大学的各种科学、文化以及体育类设施。

　　迄今为止，圣托马斯大学已经从当初的学生人数不超过500名、教职员工22名、拥有3幢建筑逐步扩大到学生人数2,500名左右、全日制教职员工121名，并且拥有了12幢建筑。

　　圣托马斯大学在加拿大是独一无二的将教育重心放在文科教育上的学校。学校认为，对于未来准备成为一名领导者、思想家和全球公民的学生来说，学习文科是一条最好的道路。圣托马斯大学采取小班教学，学生可以选择最好的教师。一般来说，每个班级不超过60名学生，平均每个班31名学生。

　　2007年度的NSSE(NationalSurveyofStudentEngagement)报告指出，圣托马斯大学的学术创新排在加拿大的前五名，学生与教授之间的沟通与互动排在加拿大的前十名，校园环境对学生学习的帮助排在加拿大的前十名，学校总体的教学经验也排在加拿大的前十名。